1954年1月,闽侯县甘蔗昙石村村民在修筑闽江防洪堤时,发现了大量白色蛤蜊壳堆积层,后来变成了重要的考古发掘。阳光下的墓葬、陶器和壕沟告诉人们一个惊喜:福建文明从这里开始。 昙石山文化遗址距今有五六千年历史,它以昙石山遗址为代表,以闽江下游为中心,以东南沿海为主要分布范围,几乎覆盖福建全境,并连接闽台两省,是东南沿海原始社会人类劳动生息的缩影,是福建古代海洋文化的摇篮,也是先秦闽族的发源地。
从1954年起,遗址进行了8次面积不等的考古发掘,总面积近2000平方米,出土可复原的器物约2000余件,另有墓葬、陶窑、壕沟等。“中华第一灯”、昙石山人颧骨、原始瓷器、提线陶簋、殉葬男奴、陶釜等文物堪称“中华之最”。
2004年,昙石山文化遗址保护和博物馆建设工程全面启动,总投资近7000万元。按规划与方案要求,昙石山遗址博物馆建设,将以突出反映地域和海洋特色的昙石山文化为主题。预计今年底可完成扩建工程。届时,昙石山博物馆将建成一个占地108亩、建筑面积达6010平方米,融博物馆、考古现场和遗址公园为一体的展示园区。游客可沿着闽江,从闽江入海口的马尾船政文化到福州的三坊七巷,再到昙石山,用一天时间就可以参观福州的三张“金名片”,了解福州乃至福建史前历史到近代历史发展演变过程。
昙石山文化遗址,2001年被国务院公布为全国第五批文物保护单位,2003年被省委、省政府列为“福建第一文化旅游品牌”。2004年,江泽民同志为昙石山遗址作“昙石山文化遗址”的题字。